-
1 primer sequence
Генетика: последовательность праймера -
2 Senger sequencing (enzymatic method)
Секвенирование по Сэнгеру (ферментативный метод) — техника секвенирования однонитчатой ДНК. В основе метода — присоединение ( отжиг, см.) к однонитчатой ДНК-мишени секвенирующего праймера (см. Праймер) или обратного секвенирующего праймера (обычно синтетических олигонуклеотидов). Реакционная смесь переносится в 4 пробирки, куда добавляются все 4 дезоксинуклеозидтрифосфата, один из которых мечен по 32P. Каждая пробирка содержит различные дидезоксинуклеозидтрифосфаты (ддАТФ, ддСТФ, ддГТФ и ддТТФ). Для синтеза комплементарной копии к однонитчатой последовательности-мишени в пробирки добавляется фрагмент Кленова (см. Кленова фрагмент). В результате происходит удлинение праймера в соответствии с матричной последовательностью. Когда в растущую цепь вместо соответствующего дНТФ в матрице включается ддМТФ, 3'-конец растущей цепи теряет гидроксильную группу и не может дальше удлиняться: цепь терминируется. В итоге каждая реакционная смесь получит популяцию радиоактивно меченных фрагментов ДНК с общим 5'-концом (праймер), но с разными 3'-концами. После окончания реакции ДНК денатурируется, подвергается электрофорезу в тонкослойном полиакриламидном геле (см. Секвенирующий гель) и с помощью радиоавтографии выявляются радиоактивные полосы. Последовательность нуклеотидов в исходной ДНК-мишени может затем прочитываться прямо с радиоавтограммы.
Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Senger sequencing (enzymatic method)
-
3 Senger sequencing (enzymatic method)
Секвенирование по Сэнгеру (ферментативный метод) — техника секвенирования однонитчатой ДНК. В основе метода — присоединение ( отжиг, см.) к однонитчатой ДНК-мишени секвенирующего праймера (см. Праймер) или обратного секвенирующего праймера (обычно синтетических олигонуклеотидов). Реакционная смесь переносится в 4 пробирки, куда добавляются все 4 дезоксинуклеозидтрифосфата, один из которых мечен по 32P. Каждая пробирка содержит различные дидезоксинуклеозидтрифосфаты (ддАТФ, ддСТФ, ддГТФ и ддТТФ). Для синтеза комплементарной копии к однонитчатой последовательности-мишени в пробирки добавляется фрагмент Кленова (см. Кленова фрагмент). В результате происходит удлинение праймера в соответствии с матричной последовательностью. Когда в растущую цепь вместо соответствующего дНТФ в матрице включается ддМТФ, 3'-конец растущей цепи теряет гидроксильную группу и не может дальше удлиняться: цепь терминируется. В итоге каждая реакционная смесь получит популяцию радиоактивно меченных фрагментов ДНК с общим 5'-концом (праймер), но с разными 3'-концами. После окончания реакции ДНК денатурируется, подвергается электрофорезу в тонкослойном полиакриламидном геле (см. Секвенирующий гель) и с помощью радиоавтографии выявляются радиоактивные полосы. Последовательность нуклеотидов в исходной ДНК-мишени может затем прочитываться прямо с радиоавтограммы.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Senger sequencing (enzymatic method)
-
4 targeted gene walking polymerase chain reaction
Шаговая полимеразная цепная реакция целевого гена — вариант обычной полимеразной цепной реакции (см.) для амплификации (см.) неизвестной последовательности ДНК, локализованной вверх или вниз (влево или вправо) от известной последовательности. Для этого первый последовательность-специфический ПЦР-праймер (целевой праймер, т.е. комплементарный экзону) и второй специфический праймер (внутренний праймер, гибридизующийся с той же нитью ДНК и расположенный близко к сайту целевого праймера) отжигаются (гибридизуются) к их целевым сайтам (мишеням) в геноме. Затем неспецифические, т.н. "шагающие" праймеры, комплементарные к последовательностям, расположенным выше или ниже мишени и сайта связывания внутреннего праймера, используются для амплификации расположенных между ними районов с помощью <I>Taq</I> ДНК-полимеразы (см. <I> полимераза Taq -полимераза </I>). Эту технику можно применять для изоляции последовательностей, прилежащих к уже известным районам без процедуры клонирования (см.) и выделения, а также для ДНК-фингерпринтинга (см.), обнаружения регуляторных районов и изолирования генов.
Англо-русский толковый словарь генетических терминов > targeted gene walking polymerase chain reaction
-
5 expression of polymerase chain reaction
Экспрессия ПЦР — техника, объединяющая ПЦР, или полимеразную цепную реакцию, с транскрипцией и трансляцией in vitro определенного фрагмента ДНК (гена) с тем, чтобы получить амплифицированный продукт (белок) (см. Амплификация). Для этого интересующий ген сначала амплифицируют с помощью ген-специфичного смыслового и антисмыслового праймеров. 5'-конец смыслового праймера содержит область из 12 перекрывающихся п. о. После процедуры амплификации этот участок удлиняется с помощью Taq-полимеразы путем присоединения экспрессионной кассеты, содержащей сайт инициации транскрипции для Т 7 РНК-полимеразы, 5'-нетранслируемую лидерную последовательность из вирусного гена и стартовый кодон ATG. Лидерная последовательность, в свою очередь, несет сайт для связывания с рибосомами. Затем такая рекомбинантная молекула амплифицируется с помощью универсального и антисмыслового праймеров. Образующийся ПЦР-продукт in vitro транскрибируется в иРНК, а затем транслируется в белок.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > expression of polymerase chain reaction
-
6 PCR-expression
Экспрессия ПЦР — техника, объединяющая ПЦР, или полимеразную цепную реакцию, с транскрипцией и трансляцией in vitro определенного фрагмента ДНК (гена) с тем, чтобы получить амплифицированный продукт (белок) (см. Амплификация). Для этого интересующий ген сначала амплифицируют с помощью ген-специфичного смыслового и антисмыслового праймеров. 5'-конец смыслового праймера содержит область из 12 перекрывающихся п. о. После процедуры амплификации этот участок удлиняется с помощью Taq-полимеразы путем присоединения экспрессионной кассеты, содержащей сайт инициации транскрипции для Т 7 РНК-полимеразы, 5'-нетранслируемую лидерную последовательность из вирусного гена и стартовый кодон ATG. Лидерная последовательность, в свою очередь, несет сайт для связывания с рибосомами. Затем такая рекомбинантная молекула амплифицируется с помощью универсального и антисмыслового праймеров. Образующийся ПЦР-продукт in vitro транскрибируется в иРНК, а затем транслируется в белок.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > PCR-expression
См. также в других словарях:
ДНК-маркер — Рис.1 Электрофорез ПЦР продуктов в агарозном геле и окрашенных бромистым этидием, полученных методом IRAP амплификации. Левая дорожка ДНК известной длины (от 900 до 3000 пар нуклеотидов) … Википедия
Полимеразная цепная реакция — (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале (пробе). Помимо амплификации ДНК, ПЦР… … Википедия
ПЦР — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Полимеразная цепная — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Виртуальная ПЦР — Виртуальная полимеразная цепная реакция (in silico ПЦР, цифровая ПЦР, электронная ПЦР, е ПЦР) математический метод компьютерного анализа теоретической полимеразной цепной реакции, используя список последовательностей праймеров (или проб)… … Википедия
Полимер — (Polymer) Определение полимера, виды полимеризации, синтетические полимеры Информация об определении полимера, виды полимеризации, синтетические полимеры Содержание Содержание Определение Историческая справка Наука о Полимеризация Виды… … Энциклопедия инвестора
Секвенирование по Сэнгеру (ферментативный метод) — * секвеніраванне па Сэнгеру (ферментатыўны метад) * Sanger sequencing (enzymatic method) техника секвенирования (см.) однонитчатой ДНК. В основе метода присоединение (отжиг, см.) к однонитчатой ДНК мишени секвенирующего праймера () или обратного… … Генетика. Энциклопедический словарь
Аденоассоциированный вирус — Н … Википедия
FastPCR — FastPCR … Википедия
Шаговая полимеразная цепная реакция целевого гена — * крокавая полімеразная ланцуговая рэакцыя мэтавага гена * targeted gene walking polymerase chain reaction вариант обычной полимеразной цепной реакции (см.) для амплификации (см.) неизвестной последовательности ДНК, локализованной вверх или вниз… … Генетика. Энциклопедический словарь
Секвенирование по Сэнгеру — Метод Сэнгера метод секвенирования (определения первичной последовательности нуклеотидов молекулы нуклеиновых кислот) ДНК и РНК. Метод Сэнгера также известен как метод обрыва цепи. Метод основан на присоединении к однонитчатой секвенируемой… … Википедия
